Цель селекционного-племенного центра заключается в  сохранении и воспроизводство генофонда эндемичных пород медоносных пчел России (среднерусской, карпатской, серой горной кавказской и дальневосточной пород), в условиях продовольственной безопасности страны и на фоне мирового коллапса медоносных пчел.

Задачи СПЦ:

1. Разработка современных биотехнологических методов воспроизводства конкурентноспособных линий и популяций медоносных пчел, наследуемых высокие показатели продуктивности и резистентности к болезням, с внедрением инструментального осеменения пчелиных маток;
2. Разработка высокоэффективных методов хранения спермы трутней, с целью ускорения селекционного процесса и получения высокопродуктивного потомства с известной наследуемостью;
3. Совершенствование технологий искусственной репродукции плодных пчелиных маток;
4. Создание банка эталонов для контроля чистопородности;
5. Разработка паспортизации пчелиных маток,  гарантировано чистых по инфекционным заболеваниям;
6. Разработка и внедрение  конкурентноспособных технологий производства, переработки и хранения продуктов пчеловодства.
7. Разработка карт медового конвейера для определенных типов и линий пчел;
8. Получение конкурентноспособной экспортной продукции, востребованной на мировом рынке в виде пчелиных маток серой горной кавказской породы, характеризующейся высокими показателями хозяйственно полезных признаков (яйценоскости пчелиных маток, медовой продуктивности, зимостойкости, а также продуктивности качественного маточного молочка).